Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管点状细胞癌的预后生物标志物

2021-11-15 05:15:50 来源:
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这项研究目的确定一种可以预见食管鳞状细胞癌(ESCC)高血压大体上存活率(OS)的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC高血压的miRNA表达谱及其相应的临床信息,并将其作为基础训练集。在后期和后期样品数间比对差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox回归深入研究、运算符特征消除(RFE)-支持向量座机(SVM)启发式和LASSO Cox回归数学方法来识别临床表现性miRNAs,从而设立临床表现满分数学方法。此外,预见了这些临床表现性miRNAs的有前途靶遗传,然后相结合了miRNA靶遗传在线。通过功能富集深入研究,深入研究了ESCC中这些临床表现性miRNAs预见靶遗传的功能相关性。

在基础训练集中,后期与后期样品有46个DEmiRNAs。设立了基于5个miRNAs的可能会满分数学方法。该5-miRNA可能会满分可以将基础训练集包含OS时数间明显不同的高危组和低危组。在一个来自癌症遗传组图谱(TCGA)的独立数据集中,取得成功可验证了5-miRNA可能会满分的可能会分层能力。已确定了与这些miRNAs相关的各种生物学过程和自营,例如Wnt信号自营、TRP通道的炎症电磁波调节自营和雌激素信号自营。

这项研究提示,与病理分期相关的5-miRNA标签对预见ESCC高血压的临床表现具有临床意义。

更早出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

本文系梅斯医学(MedSci)原创校对整理,刊出需授权!

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